4 Commits

1 changed files with 46 additions and 18 deletions
Split View
  1. +46
    -18
      Readme.md

+ 46
- 18
Readme.md View File

@ -6,11 +6,11 @@
---
## Introducción
El presente reporte muestra la actualización del comportamiento de los casos reportados como confirmados de COVID-19 por la Secretaría de Salud (SS) de México desde el 23 de marzo, cuando el Laboratorio Nacional SEDEAM inicio el reporte. Día a día se actualizan en el repositorio, con la intensión de monitorear la evolución de la PANDEMIA en nuestro país y en el estado de Michoacán. El día de hoy se cumplen 36 días desde que la OMS catalogó el COVID-19 como una pandemia. Los datos son usados para el cálculo y análisis de parámetros como: tasa de crecimiento diaria, acumulación de casos positivos y promedio de crecimiento e incremento de casos confirmados de COVID-19. Con la información se han desarrollo tres modelos para estimar, a la fecha, la dinámica de la urgencia sanitaria en México. Los modelos estudiados son: exponencial, polinomial y logarítmico. Cada caso es presentado y analizado en las siguientes secciones. Los resultados muestran que al 15 de abril y como país, representamos el 0.30% del total de casos confirmados y el 0.64% de casos nuevos a nivel mundial aproximadamente, en ambos apartados se presenta un incremento respecto al día anterior. Además, se estudia el caso particular del estado de Michoacán ya que el laboratorio nacional SEDEAM tiene una sede en la capital (MORELIA). El reporte no trata de predecir el futuro, sino de describir la evolución diaria de la Pandemia en nuestro País y nuestro Estado. Este repositorio es actualizado todos los días y su historial queda guardado para un análisis final del fenómeno.
El presente reporte muestra la actualización del comportamiento de los casos reportados como confirmados de COVID-19 por la Secretaría de Salud (SS) de México desde el 23 de marzo, cuando el Laboratorio Nacional SEDEAM inicio el reporte. Día a día se actualizan en el repositorio, con la intensión de monitorear la evolución de la PANDEMIA en nuestro país y en el estado de Michoacán. El día de hoy se cumplen 37 días desde que la OMS catalogó el COVID-19 como una pandemia. Los datos son usados para el cálculo y análisis de parámetros como: tasa de crecimiento diaria, acumulación de casos positivos y promedio de crecimiento e incremento de casos confirmados de COVID-19. Con la información se han desarrollo tres modelos para estimar, a la fecha, la dinámica de la urgencia sanitaria en México. Los modelos estudiados son: exponencial, polinomial y logarítmico. Cada caso es presentado y analizado en las siguientes secciones. Los resultados muestran que al 16 de abril y como país, representamos el 0.32% del total de casos confirmados y el 0.59% de casos nuevos a nivel mundial aproximadamente, resgistrando un decremento respecto al día anterior en la participación de casos nuevos. Además, se estudia el caso particular del estado de Michoacán ya que el laboratorio nacional SEDEAM tiene una sede en la capital (MORELIA). El reporte no trata de predecir el futuro, sino de describir la evolución diaria de la Pandemia en nuestro País y nuestro Estado. Este repositorio es actualizado todos los días y su historial queda guardado para un análisis final del fenómeno.
### Modelo exponencial
El modelo exponencial se ajusta para una tasa diaria de crecimiento de contagio de 0.109 la cual presentó un ligero descenso respecto a la tasa del día anterior. A este ritmo se puede estimar un promedio de 6.76 casos confirmados por hora desde que se inició el registro y de 18.6 casos confirmados por hora durante la jornada de hoy. En la siguiente figura se pueden observar los registros diarios representados por círculos, mientras que el comportamiento del modelo se pude observar con una línea gris. Este modelo generó una estimación con un error del 6.7% por arriba del registro actual.
El modelo exponencial se ajusta para una tasa diaria de crecimiento de contagio de 0.106 la cual presentó un ligero descenso respecto a la tasa del día anterior. A este ritmo se puede estimar un promedio de 7.09 casos confirmados por hora desde que se inició el registro y de 18.75 casos confirmados por hora durante la jornada de hoy. En la siguiente figura se pueden observar los registros diarios representados por círculos, mientras que el comportamiento del modelo se pude observar con una línea gris. Este modelo generó una estimación con un error del 7% por arriba del registro actual.
![](figuras/Abril16-1.png)
@ -23,55 +23,83 @@ Por su parte el modelo logarítmico, del tipo ln[f(x)]=ax+b, destacando la tende
### Factor de crecimiento de los casos reportados
El factor de crecimiento se estima día a día respecto a los casos confirmados. La jornada no presentó cambio con respecto al día anterior, registrando un factor de contagio de 1.08 al registrar 448 nuevos casos confirmados.
El factor de crecimiento se estima día a día respecto a los casos confirmados. La jornada no presentó cambio con respecto al día anterior, registrando un factor de contagio de 1.08 al registrar 450 nuevos casos confirmados.
![](figuras/Abril16-4.png)
La tasa de letalidad continúa en ascenso, registrando un acumulado de 449 decesos para una tasa de 7.67 defunciones por cada 100 casos confirmados a nivel nacional por arriba de la tasa global de 6.4, respecto a los casos confirmados respectivamente, en la jornada de hoy se presentaron 43 nuevos fallecimientos, lo que representa un 58% de los fallecimientos registrados el día anterior. Al respecto se presenta la gráfica, la cual se ajusta a un modelo tipo exponencial.
La tasa de letalidad continúa en ascenso, registrando un acumulado de 486 decesos para una tasa de 7.72 defunciones por cada 100 casos confirmados a nivel nacional por arriba de la tasa global de 6.6, respecto a los casos confirmados respectivamente, en la jornada de hoy se presentaron 37 nuevos fallecimientos, lo que representa un 14% menos de los fallecimientos registrados el día anterior. Al respecto se presenta la gráfica, la cual se ajusta a un modelo tipo exponencial.
![](figuras/Abril16-8.png)
### Estimación y análisis a partir del modelo exponencial
### Estimación y análisis a partir del modelo exponencial y el modelo de Gompertz
Adicionalmente se analiza el incremento diario de casos confirmados, el cual se ha venido justado a un modelo de tipo exponencial con un incremento en el actual dato registrado, véase la figura de abajo. Este modelo permite observar el crecimiento de casos confirmados de una manera oscilatoria sobre la línea de tendencia, que para este 15 de abril registró una tasa aproximada de 0.080 día transcurrido por caso confirmado.
Adicionalmente se analiza el incremento diario de casos confirmados, el cual se ha venido justado a un modelo de tipo exponencial con un incremento en el actual dato registrado, véase la figura de abajo. Este modelo permite observar el crecimiento de casos confirmados de una manera oscilatoria sobre la línea de tendencia, que para este 16 de abril registró una tasa aproximada de 0.079 día transcurrido por caso confirmado, pero con un error significativo.
De los análisis realizados durante los últimos días con los diferentes modelos, los cuales han sido consistentes, presentando un error menor al 1% en el límite inferior del intervalo de estimación, por lo que se pueden establecer para el día 15 de abril una estimación de 6332 a 6476 casos confirmados para un valor esperado de 6404, significando un incremento estimado de entre 485 y 620, para un valor esperado de 557 nuevos casos.
![](figuras/Abril16-5.png)
La función de Gompertz, es ampliamente utilizada en biología como modelo de regresión para estudiar el crecimiento de las poblaciones de animales, bacterias, crecimiento de tumores y supervivencia de pacientes de cáncer, y por supuesto modelos de infección.
![](figuras/Abril16-5.png)
La curva de Gompertz o la función de Gompertz, es un tipo de modelo matemático para una serie de tiempo que lleva el nombre de su creador Benjamin Gompertz (1779-1865). Es una función sigmoidea que tiene forma de sigma mayúscula. Muchos procesos naturales de sistemas complejos muestran una progresión temporal desde unos niveles bajos al inicio, hasta acercarse a un clímax o punto máximo transcurrido un cierto tiempo; la transición se produce en una región caracterizada por una fuerte aceleración intermedia.
La función de Gompertz es muy similar a la función logística, pero se diferencia de ella en que es asimétrica. El crecimiento es más rápido al principio de la curva que al final. Esta pequeña diferencia la hace más apropiada para describir el crecimiento biológico.
La función de Gompertz es la solución a la ecuación diferencial que describe los cambios en la población (P) con el paso del tiempo (t) en función de su capacidad de crecimiento intrínseca (c constante) y la máxima población que el ecosistema puede soportar, lo que se define como capacidad de carga (K, carrying capacity).
La ecuación diferencial que describe el comportamiento de las poblaciones es:
dP/dt = c ln(K/P)P
Esta ecuación cuando se integra y resuelve nos da la función de Gompertz, que describe los cambios en la población en función del tiempo:
P(t) = K e^-ln(K/P0) e^-ct
Donde P0 es el tamaño de la población inicial. Esta ecuación se puede escribir de varias formas equivalentes.
Tomando el cuenta el factor establecido por la Secretaria de Salud para la estimación total de contagios a la fecha sería de 47946 contagios posibles en todo el país, que para esta jornada se puede considerar existen aproximadamente 36229 posibles contagios existentes no identificados.
Para este modelo se corrieron los datos de los casos confirmados de COVID19 en México, desde el reporte del 28 de febrero cuando se registraron los 2 primeros casos confirmados hasta los 5847 del día 15 de abril, toda vez que el modelo exponencial comenzaba a alejarse del comportamiento real y por lo tanto el ajuste de este modelo presentaba un error mayor al 7% en las estimaciones. De igual manera y una vez que el equipo experto de la Secretaria de Salud del Gobierno Federal explicara y determinara las fechas estimadas para la definición de estrategias tanto para la fase 3 como para el levantamiento gradual de la contiengencia epidemiológica en el territorio nacional y habiendo corrido por nuestra parte, en varias ocasiones el modelo de Gompertz referido por el grupo experto como un modelo válido para el ajuste y para la estimación, el equipo de análisis del Laboratorio Nacional de Sistemas Embebidos sede Morelia, decidimos explicar en función de esta información dicho modelo y clarificar aspectos relevantes del mismo para continuar describiendo el comportamiento tanto a nivel nacional como a nivel estatal.
Respecto a la distribición de la Pandemia en el territorio, la CDMX concentra el 28.79% de los casos confirmados, el Estado de México el 11.25%; seguidos de Baja California con el 7.92%, Sinaloa con el 4.99%, Puebla con el 4.97%, y Quintana Roo con el 4.59%, siendo estos Estados quienes concentran el 62.52% del total de los casos confirmados y poco más del 32% de la población total del país.
El modelo matemático resultante fue el siguiente:
Y = a * EXP (-EXP (b – c * t))
donde:
Y es el número de nuevos casos confirmado por día
K, b y c son constantes del modelo que nos serviran para explicar el comportamiento del fenómeno
t es el tiempo (días) transcurrido desde el registro de los datos
En la jornada de hoy los estados de Campeche, Tabasco y Chihuahua presentaron los mayores incrementos relativos de casos confirmados, así como la CDMX con el mayor número absoluto registrando por si solo 130 de los 448 casos confirmados, cabe destacar los casos de Colima que durante los últimos 6 días no presentaron incremento en sus registros y los casos de Jalisco y San Luis Potosí que presentaron incrementos negativos importantes.
El modelo obtenido fue:
Caso nuevos = 932.457 * EXP (-EXP (2.50303 – 0.0585782 * t))
Donde, K es la capacidad de carga del sistema y refleja el máximo de casos que se van a alcanzar, correspondiendo a la asíntota superior, por lo que el valor máximo de casos confirmados esperado en la Republica Mexicana sería de 933 nuevos casos por día, donde se habrá de estabilizar el crecimiento, para una constante de crecimiento por día de c = 0.0585782
El modelo de Gompertz como todos los modelos sigmoideos presentan 4 fases: la fase lag o de adaptación y tambien llamada de latencia, la fase exponencial, la fase estacionaria y la de muerte, para lo cual se calculan los siguientes tiempos:
La duración de la fase de latencia o desarrollo se obtiene de la razón (b-1)/c y corresponde a 25.65 días, esta fase representa un período de transición antes de comenzar el crecimiento exponencial, que concluyó aproximadamente entre el día 23 y 25 de marzo.
En la fase exponecial es importante calcular la velocidad específica de crecimiento (VEC) que se obtiene del producto de K*c y corresponde aproximadamente a 55 días, que se mantiene hasta la fecha del 17 de mayo, dando paso a la fase estacionaria.
Con base en este modelo es posible estimar el comportamiento del fenómeno y establecer los casos confirmados, los contagios totales no identificados, así como los fallecimientos con base en las tasas que se actualizan día a día.
De los análisis realizados durante los últimos días con los diferentes modelos, se pueden establecer para el día 17 de abril una estimación de 6782 a 6801 casos confirmados para un valor esperado de 6792, significando un incremento estimado de entre 485 y 504, para un valor esperado de 495 nuevos casos.
Tomando el cuenta el factor establecido por la Secretaria de Salud para la estimación total de contagios a la fecha sería de 52454 contagios posibles en todo el país, que para esta jornada se puede considerar existen aproximadamente 40114 posibles contagios existentes no identificados.
---
## Estimaciones para el estado de Michoacán
Para el caso de Michoacán, hoy 15 de abril se reportaron 7 nuevos casos, acumulando un total de 79 casos confirmados que representan el 1.35% de casos confirmados y el 1.56% de los casos nuevos del total nacional respectivamente. El modelo lineal continúa explicando la dinámica de la Pandemia para el Estado aunque el crecimiento en los últimos 5 días respecto a la línea de regresión representa ya una tendencia y un reajuste a dicho modelo, el cual, estima que por cada día transcurrido, se presentan 2.69 casos confirmados aproximadamente (ver figura 6), mientras el valor real promedio es de 3.0 casos confirmados por día desde que se inició el registro y de 1 caso confirmado cada 3.4 horas para la jornada de hoy.
Para el caso de Michoacán, hoy 16 de abril se reportaron 21 nuevos casos e triple respecto al día anterior, acumulando un total de 100 casos confirmados que representan el 1.59% de casos confirmados y el 4.66% de los casos nuevos del total nacional respectivamente. Para el día de hoy el modelo lineal presentó un error significativo, por lo que se corrió el modelo exponencial el cual ajustó de forma adecuada y explicando la dinámica de la Pandemia para el Estado, el cual, estima que por cada día transcurrido
![](figuras/Abril16-6.png)
El factor de crecimiento diario de casos confirmados con virus COVID-19 presentó un incremento al pasar de 1.06 a 1.10, el cual es mayor al factor nacional para esta jornada de 1.08. Por otra parte, este factor se mantiene por debajo del factor promedio acumulado de 1.14 en Michoacán y tambien por debajo del promedio nacional acumulado de 1.21.
El factor de crecimiento diario de casos confirmados con virus COVID-19 presentó un incremento al pasar de 1.10 a 1.27, el cual es mayor al factor nacional para esta jornada de 1.08. Por otra parte, este factor alcanzón el pico mas alto de los días sobrepasando del factor promedio acumulado de 1.14 en Michoacán así como el promedio nacional acumulado de 1.21.
![](figuras/Abril16-7.png)
Cabe destacar, que el estado de Michoacán, se mantiene en la posición 11 de los Estados del país con la menor proporción de casos confirmados respecto al total de su población y en la posición número 16 con la menor proporción de contagio respecto al total de casos confirmados. Con relación al total de fallecimientos, a la fecha se han acumulado un total de 13 defunciones representando el 2.89% del total nacional registrando una tasa de letalidad de16.4 defunciones por cada 100 casos confirmados.
Con relación al total de fallecimientos, a la fecha se han acumulado un total de 14 defunciones representando el 2.88% del total nacional registrando una tasa de letalidad de14 defunciones por cada 100 casos confirmados.
Respecto a las distribución en el territorio del Estado, el municipio de Morelia concentra el 31.64% de casos confirmados, el municipio de Lázaro Cardenas el 12.65%, La Piedad, Tzintzuntzan, Uruapan y Venustiano Carranza con el 7.59% respectivamente, el restante 25.31% distribuido en 14 municipios. Lo que representa una expansión de la Pandemia en el 17.7% de los municipios del Estado, siendo el municipio de Venustiano Carranza el que mayor casos confirmados presentó durante el día de hoy.
Respecto a las distribución en el territorio del Estado, el municipio de Morelia concentra el 28% de casos confirmados, el municipio de Lázaro Cárdenas el 23%, Uruapan 8%, La Piedad 7%, Tzintzuntzan y Venustiano Carranza 6% respectivamente, el restante 22% distribuido en 16 municipios. Lo que representa una expansión de la Pandemia en el 19.5% de los municipios del Estado, siendo el municipio de Lázaro Cárdenas el que mayor casos confirmados presentó durante el día de hoy. Respecto a la edad de los casos confirmados, se mantiene la prevalencia de las personas de género masculino mayores de 60 años.
Respecto a la edad de los casos confirmados, se mantiene la prevalencia de las personas de género masculino mayores de 60 años. Con relación a la dinámica de contagio se puede establecer que el 48% corresponde a contagios autóctonos o de segunda generación y el 40% siguen siendo casos importados.
Del análisis anterior, se desprende una estimación para el día 17 de abril de 110 a 127 casos confirmados en el Estado.
Del análisis anterior, se desprende una estimación para el día 16 de abril de 81 a 87 casos confirmados en el Estado.
Tomando el cuenta el factor establecido por la Secretaria de Salud para la estimación total de contagios a la fecha serían de 833 contagios posibles en todo el Estado, que para esta jornada se puede estimar un total aproximado de 630 posibles contagios existentes no identificados.
Tomando el cuenta el factor establecido por la Secretaria de Salud para la estimación total de contagios a la fecha serían de 591 contagios posibles en todo el Estado, que para esta jornada se puede considerar existen aproximadamente 457 posibles contagios existentes no identificados.

Loading…
Cancel
Save